最高權力機構：會員代表大會
理事會：會員代表大會的執行機構，領導協會開展日常工作，由中國飲料行業、企業界相關部門的專家、企業家、管理人員組成，由會員代表大會推薦選舉產生，至今為第五屆。
理 事 長： |
趙亞利 |
副理事長： |
康永璞，葉紅漢，陳生，欒秀菊，張建弢，朱新禮，郭一民，邰祥梅，周濤，劉洪基，鐘睒睒，盧戰，
宗慶后，李兆軍，姚奎章，仲兆敏，蔣建琪，董玉國，韋俊賢，周敬良，王光興，葉美蘭，陳清水
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秘 書 長： |
程毅 |
辦事機構：中國飲料工業協會秘書處，在會員代表大會閉幕以后，執行理事會決議，主持和創造性地開展日常工作。內設黨支部，綜合部，行業發展部，信息部，質量法規部，外聯部，會員部，雜志社，展覽部，財務部。
分支機構：天然礦泉水分會；果蔬汁分會；碳酸飲料分會；供應商分會；固體飲料分會；咖啡與茶飲料分會；包裝飲用水分會；技術工作委員會。
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